蚵架掛潟湖，美景繫黃昏
北門區之生態環境屬於潟湖生態，蘊含著豐富之魚、蝦、貝類及紅樹林景觀，於急水溪口南岸林間常見有許多鷺鳥和其他水鳥，彈塗魚和各種螃蟹，具有潟湖觀光生態旅遊之魅力。
其中最讓人注目的是每年10月到翌年4月到此作客的黑腹燕鷗，每到黃昏成群的黑腹燕鷗會在空中群聚飛舞，依照風向變換各種不同隊型，相當壯觀。
北門潟湖區介於王爺港汕和內陸間，海茄苳紅樹林曾經大量生長在北門蚵寮西邊的北門潟湖區沼澤地帶，後來開發為海埔新生地或闢為魚塭，此區經常可見許多蚵架插置潟湖中，形成另一特殊的海岸景觀。
在台南政府全力復育紅樹林的政策下，潟湖南邊之頭港大排水，出海口之河床也長有面積約6公頃的海茄苳；在急水溪出海口淤沙較多的北門潟湖區海茄苳也再度繁殖，並引進種植水筆仔，在這兩個據點設置紅樹林保護區，並立有公告牌標示保育措施。
